No es totalmente diferente, la versión del S.O, es muy diferente del Service Pack, Windows 2008 R2 es versión del sistema operativo que viene a 64 Bits y es una mejor a la version 2008 estandard, lo que estas viendo en propiedaes del sistema, es que tiene aplicado con el service pack 2.
Los Service Pack lo que hacen son mejoras en cuanto a seguridad y complementos y compatibilidad de hardware y el sistema operativo.