hay configuraciones que solo se pueden realizar en uno de los dos.
todas las configuraciones estan repartidas en estas dos areas usuario y equipo.
una configuracion realizada en usuario afectara al usuario en cuestion en cambio una configuracion en equipo afecta al equipo y por ende a todos los usuarios en el.
por ejemplo puedo configurar el firewall de windows en equipo y el fondo de pantalla en usuarios
espero ser claro