Buenas tardes,
Si bien la información que das es mínima y probablemente se requiera de más datos para poder ser específicos en la respuesta, te doy algunas variantes:
Si es una migración de Active Directory, tenés que despromover el Servidor con W2K3 cuya función hasta el momento fuera la de Domain Controller, para ello pódés despromoverlo correctamente desde el contenedor Domain Controllers, eligiendo la opción que corresponde, y luego eliminar los registros en el DNS, tenés que revisar las zonas de búsqueda directa y reversa y eliminar los que te aparezcan. Si hubiera sido mal despromovido, vas a tener que hacer una limpieza de metadata de active directory, si buscás el KB en Microsoft te explica el procedimiento.
Si es una migración de otros Roles, como por ejemplo, File Server, Terminal Server, Print Server, DHCP Server, etc, etc, basta con desinstalar los servicios que estuvieran corriendo en ese Servidor (lo que incluye desinstalar los roles desde el Server Manager), y luego eliminar los registros en el DNS como en el punto anterior.
Recordá que, si corría un DNS, DHCP, los cuales entran en la categoría de Servicios de Red y sirven a los Clientes de la Red, vas a tener que direccionar los mismos hacia el nuevo Servidor.
Saludos,