CAAB,
El programa deberia soportar ambiente en Teminal Server en primera instancia y en segunda, debe ser instalado desde Agregar o Quitar programas para que tome el modo Terminal Server y en tercer lugar un controlador de dominio no deberia ser usado para dicho fin y ademas no puede convertirse en Terminal Server, el maximo de conexiones adminitido para administrar es de 2 usuarios concurrentes.
Deberias pensar en montar un nuevo servidor miembro con Hyper-V y dentro VMs con servicio de TS y TemoteApp u obviar el Hyper-V si no deseas virtualizar.
Saludos.