Hola,
Ten en cuenta que el DFS depende del Active Directory para la replicacion y si tienes buenos enlaces, sin caidas y sin problemas de puertos, y el AD esta ok y replicando correctamente no deberias tener ningun inconveniente. Es mas puedes setear el ancho de banda reducido en la franja horaria laboral y full por las noches, adicionalmente, puede armar una topologia de replicacion unidireccional, haciendo un No Topology y agregando una nueva conexion desde el source hacia el destino, quitandole el tilde que te crea una conexion inversa.
El DFS tiene la contra de que si la replicacion es en ambos sentidos y utilizas planillas excel, se cumple la regla de que el ultimo que graba los cambios gana, y el documento queda almacenado en el folder de ConflictedAndDeleted,
Para lo cual te recomiendo un File Server en Cluster y luego montas DFS en modo Single con replicacion unidireccional.