Hola Anibal, no es posible migrar directamente de windows 2000 a windows server 2008, debes pasar obligatoriamente por windows server 2003, es decir: primero debes realizar la migración de windows 2000 a windows server 2003, aunque sea puntualmente. El video que viste en la web de tooltorials.com te será de gran ayuda ya que es el paso fundamental en este proceso que deseas llevar a cabo. Una vez que que desarrolles esta primera fase te será un poco más fácil realizar la segunda, (migrar a windows server 2008), ademas habrás ganado un poco más de experiencia en el tema, ya que estas tareas son un tanto similares, claro está, antes de hacer nada siempre debes documentarte. En cuanto a elevar el nivel funcional, debes tener en cuenta que este es el último paso(PERO NO EL MENOS IMPORTANTE) en la migración a tu nuevo controlador de dominio con Windows Server 2003, pero para que este paso sea efectivo debes degradar tu controlador de dominio con windows 2000 y una vez degradado ya puedes elevar el nivel funcional. En cuanto a los servidores NT miembros, no se ven afectados, estos pueden seguir funcionando.
Te aconsejo también que primero escribas en papel todas las tareas que vas a realizar para que tengas un orden lógico. El otro consejo y mas importante es que una vez que tengas definido lo que vas hacer, realices primeramente pruebas en un entorno virtual para que veas como se desarrolla el proceso y puedas corregir las deficiencias, si todo te sale correcto, entonces ya estarás en condiciones de poner el plan en práctica en tus servidores. Recuerda que tus servidores se encuentran en producción y que tienes usuarios, y que un pequeño fallo te puede dañar tu infraestructura.
Saludos.