Buen día,
Bourne_eps, quizas este articulo te pueda ayudar con tu inconveniente: Link.
Por otro lado te recomendaría que generaras Cuotas de disco configurando alertas para que no te vuelva pasar ese evento, también FileScreen para evitar que los usuarios suban archivos no permitidos (dependiendo las políticas de la empresa).
Por ultimo también te podrías apoyar de la reportería que genera FRSM para detectar cuales son los archivos que esten duplicados, que sean muy antiguos.
Cabe resaltar que te hago estas recomendaciones sin saber la configuración del File Server.
Cualquier duda o inquietud con gusto me puedes contactar por Skype: dvr757