Hola que tal,
me paso algo parecido, pero es un poco complicado.
primero trata de hacerle un CHKDSK /R va a demorar un poco
luego haz el test de memoria,
por ultimo considera que es el disco si haces una imagen del disco seria mejor, puede que el disco este defectuoso electronicamente o en los platillos.
también puede ser un driver mal instalado,
y ahora lo que me paso y lo resolvió fue cambiarle de placa..
la solicite no fue barato pero me soluciono el problema pues resulta que, en el tiempo de uso hay condensadores que se recalientan mucho y tienen a degradarse.. eso me dijeron,
espero que sea de tu ayuda esto