Hola serba_tech
En las entradas no tienes que hacer nada para especificar DNS primario y secundario, donde pones tu DNS primario y secundario es en la configuración TCP/IP en los equipos que utilizas ip estatica como se muestra en la imagen.
El otro caso seria establecer DNS primario y secundario en la configuración del servicio DHCP como se muestra en la imagen, este para las PCs clientes que utilizan ip dinámica. en este ejemplo la ip 10.10.10.1 es el DNS primario y la 10.10.10.2 es DNS secundario.
Creo que eso es lo que necesitas hacer, en AD no tienes que hacer nada tampoco, en caso de estar equivocado por favor me lo haces saber.
Editado:
Has esto: pones a DC1 como primario en el mismo y a DC2 como secundario, en DC2 pones a DC1 como primario y a DC2 como secundario en el mismo. Igual si pones a DC2 como primario en el mismo no deberias de tener problemas en resolución de nombres, siempre y cuando la replicacion entre DC1 y DC2 este funcionando correctamente ninguno de los 2 tendrán problemas de resolución en el dominio ya que los 2 DC tendrán la misma información de los registros en DNS.
Recuerda actualizar la información en el servicio de DHCP.
DC2 lo puedes promover sin ningún problema,eso si debes promoverlo como DC de adicional del dominio que ya tienes creado.
Saludos
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