Hola Jose Luis,
A ver si logre entender, el servidor es un equipo critico que no puede estar detenido, el disco espejo secundario está dañado y solo cuentas con el principal.
Yo haría lo siguientes,
1.- Lo primero que yo haría en tu situación, es iniciar el sistema operativo con el disco principal.
2.- Luego convertiría mi sistema operativo a máquina virtual con VMWare Converter , en un equipo con recursos suficientes para trabajar al menos en 80%. http://www.bujarra.com/ProcedimientoVMWareConverter.html
3.- Repararía el equipo Físico con sus arreglos de discos correspondientes, con más calma.
5.- Valoraría el utilizar virtualización si el equipo físico si me lo permite y separar roles, para no encontrarme en situaciones cuello de botella.
Eso Si…. Antes de hacer esto te recomiendo valores los roles del servidor actual, pues no los mencionas. Si tienes un servidor de archivos o una base de datos SQL no te lo aconsejaría, a menos que no tuvieras otra opción; con esto al menos garantizaria que la organizacion no perdera ingresos por estar detenido el servidor.